Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHST12Q9NRB3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHST12Q9NRB3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms