Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZDHHC4Q9NPG8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC4Q9NPG8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms