Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KIAA1549Q9HCM3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms