Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CWC22Q9HCG8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CWC22Q9HCG8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CWC22Q9HCG8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CWC22Q9HCG8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CWC22Q9HCG8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms