Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
REXO4Q9GZR2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
REXO4Q9GZR2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms