Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC32Q9BV29 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC32Q9BV29 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms