Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC39A3Q9BRY0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms