Protein–RNA interactions for Protein: Q99626

CDX2, Homeobox protein CDX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDX2Q99626 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDX2Q99626 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDX2Q99626 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms