Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LGMNQ99538 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LGMNQ99538 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms