Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD27Q96NW4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD27Q96NW4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms