Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RDH12Q96NR8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RDH12Q96NR8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms