Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CCDC7Q96M83 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC7Q96M83 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC7Q96M83 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms