Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMX3Q96JJ7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms