Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RNF185Q96GF1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RNF185Q96GF1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms