Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
STAMBPL1Q96FJ0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
STAMBPL1Q96FJ0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms