Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCC1Q96CN9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms