Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC102AQ96A19 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC102AQ96A19 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms