Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FRAT1Q92837 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FRAT1Q92837 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FRAT1Q92837 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.4 ms