Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZIC4Q8N9L1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZIC4Q8N9L1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms