Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC83Q8IWF9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC83Q8IWF9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC83Q8IWF9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms