Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP1Q7Z6B7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP1Q7Z6B7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP1Q7Z6B7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP1Q7Z6B7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP1Q7Z6B7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP1Q7Z6B7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP1Q7Z6B7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP1Q7Z6B7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP1Q7Z6B7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP1Q7Z6B7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP1Q7Z6B7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SRGAP1Q7Z6B7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms