Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms