Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT89

SLC25A48, Solute carrier family 25 member 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A48Q6ZT89 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC25A48Q6ZT89 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC25A48Q6ZT89 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms