Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNT2Q6UVM3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNT2Q6UVM3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms