Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC9A4Q6AI14 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC9A4Q6AI14 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A4Q6AI14 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms