Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF20Q5VTR2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF20Q5VTR2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms