Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PCID2Q5JVF3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCID2Q5JVF3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PCID2Q5JVF3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms