Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPL39P5Q59GN2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms