Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESCO2Q56NI9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ESCO2Q56NI9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms