Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC153Q494R4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC153Q494R4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC153Q494R4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC153Q494R4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC153Q494R4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC153Q494R4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC153Q494R4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC153Q494R4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC153Q494R4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC153Q494R4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms