Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
LSM12Q3MHD2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSM12Q3MHD2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms