Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERCC6LQ2NKX8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms