Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CSPP1Q1MSJ5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSPP1Q1MSJ5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSPP1Q1MSJ5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms