Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 SCML1-204ENST00000398080 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.761e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 CCNL1-213ENST00000471044 753 ntTSL 29.71□□□□□ -0.861e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SCML1-202ENST00000380043 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.991e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SCML1-206ENST00000427362 846 ntTSL 56.85□□□□□ -1.311e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.381e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 EHBP1-210ENST00000444311 460 ntTSL 54.54□□□□□ -1.681e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 EHBP1-215ENST00000469591 886 ntTSL 54.44□□□□□ -1.71e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 EHBP1-212ENST00000454124 329 ntTSL 33.83□□□□□ -1.81e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.121e-21■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 GMPR-203ENST00000543191 675 ntTSL 28.17□□□□□ -1.11e-21■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.983e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 WWOX-215ENST00000569332 1856 ntTSL 220.14■□□□□ 0.813e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 AKAP8L-203ENST00000594594 2251 ntTSL 519.6■□□□□ 0.733e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.273e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 AKAP8L-220ENST00000609519 2113 ntTSL 216.6■□□□□ 0.253e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.173e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.153e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.113e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 AKAP8L-202ENST00000593845 2749 ntTSL 215.19■□□□□ 0.023e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 AKAP8L-209ENST00000595879 790 ntTSL 315.07■□□□□ 03e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 03e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.283e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 ARAP1-210ENST00000465814 5612 ntTSL 212.12□□□□□ -0.473e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.493e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 ARAP1-208ENST00000452383 994 ntTSL 311.64□□□□□ -0.553e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.553e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.613e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.623e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 ARAP1-206ENST00000427971 1101 ntTSL 510.22□□□□□ -0.773e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 ARAP1-205ENST00000426523 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.933e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 ARAP1-207ENST00000429686 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.073e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 AKAP8L-206ENST00000595087 796 ntTSL 26.31□□□□□ -1.43e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 AKAP8L-217ENST00000600065 679 ntTSL 36.23□□□□□ -1.413e-6■□□□□ 8.6
SRSF7Q16629 U2SURP-205ENST00000467348 1267 ntTSL 55.8□□□□□ -1.488e-8■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 U2SURP-211ENST00000488497 3557 ntTSL 1 (best)5.02□□□□□ -1.618e-8■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.778e-8■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 OGT-211ENST00000498566 601 ntTSL 33.71□□□□□ -1.823e-9■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.898e-8■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 U2SURP-209ENST00000480029 2855 ntTSL 22.58□□□□□ -28e-8■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 U2SURP-203ENST00000463563 4364 ntTSL 22.17□□□□□ -2.068e-8■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 PLK1-208ENST00000568568 582 ntTSL 312.06□□□□□ -0.481e-6■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 PLK1-207ENST00000567897 711 ntTSL 311.17□□□□□ -0.621e-6■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.321e-8■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 ZNF117-202ENST00000487644 1837 ntTSL 24.12□□□□□ -1.751e-8■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.033e-6■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.213e-6■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 RAB17-202ENST00000392001 1792 ntTSL 1 (best)12.99□□□□□ -0.333e-6■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.363e-6■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 RAB17-206ENST00000414278 1511 ntTSL 212.57□□□□□ -0.43e-6■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 RAB17-205ENST00000411462 663 ntTSL 211.82□□□□□ -0.523e-6■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 RAB17-210ENST00000477149 3211 ntTSL 1 (best)11.11□□□□□ -0.633e-6■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 TAF15-203ENST00000603393 1214 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.113e-13■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 TAF15-214ENST00000605649 776 ntTSL 514.34□□□□□ -0.113e-13■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 TAF15-212ENST00000604879 808 ntTSL 511.41□□□□□ -0.583e-13■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 TAF15-213ENST00000605197 760 ntTSL 211.41□□□□□ -0.583e-13■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 TAF15-201ENST00000603067 580 ntTSL 55.42□□□□□ -1.543e-13■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.438e-8■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.168e-8■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 TRIB3-203ENST00000449710 1070 ntTSL 513.78□□□□□ -0.28e-8■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.678e-8■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 TRIB3-204ENST00000615226 877 ntTSL 34.1□□□□□ -1.758e-8■□□□□ 8.5
SRSF7Q16629 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.124e-11■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.64e-11■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.884e-11■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.337e-12■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.217e-12■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 CCT5-203ENST00000503026 1933 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.887e-12■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 CCT5-213ENST00000515390 1728 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.187e-12■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 CCT5-210ENST00000511995 1091 ntTSL 27.67□□□□□ -1.187e-12■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 CCT5-201ENST00000280326 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.377e-12■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 THRAP3-203ENST00000469141 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.785e-8■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.835e-8■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 UFD1-204ENST00000447868 596 ntTSL 319.77■□□□□ 0.765e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.625e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.445e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.35e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.155e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 PILRB-204ENST00000438028 1822 ntTSL 1 (best)15.91■□□□□ 0.145e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 PILRB-202ENST00000422808 1599 ntTSL 1 (best)15.87■□□□□ 0.135e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.115e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 PILRB-206ENST00000443526 1364 ntTSL 1 (best)15.71■□□□□ 0.115e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 PILRB-210ENST00000457519 2074 ntTSL 1 (best)15.55■□□□□ 0.085e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 SRSF4-206ENST00000605204 1399 ntTSL 1 (best)15.3■□□□□ 0.045e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.015e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.025e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 PILRB-201ENST00000419749 1506 ntTSL 1 (best)14.82□□□□□ -0.045e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 SRSF4-202ENST00000466448 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.5□□□□□ -0.095e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.175e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.25e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.245e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 RSRP1-208ENST00000561867 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.12□□□□□ -0.315e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 RSRP1-219ENST00000568701 629 ntAPPRIS ALT2 TSL 413.12□□□□□ -0.315e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 RSRP1-217ENST00000568254 2013 ntTSL 1 (best)13.07□□□□□ -0.325e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 RSRP1-220ENST00000568996 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.62□□□□□ -0.395e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 RABL6-205ENST00000435930 3328 ntTSL 212.56□□□□□ -0.45e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 STAG3L5P-PVRIG2P-PILRB-202ENST00000444874 2661 ntTSL 212.22□□□□□ -0.455e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 RSRP1-204ENST00000473314 3034 ntTSL 211.87□□□□□ -0.515e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 PILRB-203ENST00000431140 772 ntTSL 311.55□□□□□ -0.565e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 PILRB-211ENST00000493091 4345 ntTSL 211.31□□□□□ -0.65e-6■□□□□ 8.4
SRSF7Q16629 PILRB-209ENST00000455145 902 ntTSL 510.86□□□□□ -0.675e-6■□□□□ 8.4
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