Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF239Q16600 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF239Q16600 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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