Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FXNQ16595 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
FXNQ16595 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FXNQ16595 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FXNQ16595 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
FXNQ16595 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
FXNQ16595 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FXNQ16595 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FXNQ16595 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FXNQ16595 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FXNQ16595 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
FXNQ16595 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
FXNQ16595 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
FXNQ16595 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
FXNQ16595 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FXNQ16595 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FXNQ16595 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FXNQ16595 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FXNQ16595 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FXNQ16595 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FXNQ16595 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FXNQ16595 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FXNQ16595 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FXNQ16595 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
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FXNQ16595 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FXNQ16595 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FXNQ16595 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FXNQ16595 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FXNQ16595 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FXNQ16595 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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FXNQ16595 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FXNQ16595 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FXNQ16595 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FXNQ16595 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FXNQ16595 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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FXNQ16595 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FXNQ16595 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FXNQ16595 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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FXNQ16595 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FXNQ16595 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FXNQ16595 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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FXNQ16595 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FXNQ16595 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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FXNQ16595 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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FXNQ16595 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FXNQ16595 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FXNQ16595 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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FXNQ16595 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FXNQ16595 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FXNQ16595 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FXNQ16595 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FXNQ16595 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FXNQ16595 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FXNQ16595 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FXNQ16595 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FXNQ16595 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FXNQ16595 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FXNQ16595 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FXNQ16595 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FXNQ16595 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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