Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TAF9Q16594 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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TAF9Q16594 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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TAF9Q16594 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TAF9Q16594 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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