Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
HERC1Q15751 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
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