Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP1Q15431 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SYCP1Q15431 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms