Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KARSQ15046 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KARSQ15046 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KARSQ15046 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KARSQ15046 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KARSQ15046 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KARSQ15046 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KARSQ15046 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KARSQ15046 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KARSQ15046 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KARSQ15046 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KARSQ15046 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KARSQ15046 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KARSQ15046 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KARSQ15046 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KARSQ15046 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KARSQ15046 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KARSQ15046 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KARSQ15046 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KARSQ15046 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KARSQ15046 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KARSQ15046 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KARSQ15046 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KARSQ15046 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KARSQ15046 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KARSQ15046 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KARSQ15046 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KARSQ15046 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KARSQ15046 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KARSQ15046 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KARSQ15046 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KARSQ15046 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KARSQ15046 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KARSQ15046 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
KARSQ15046 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KARSQ15046 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KARSQ15046 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KARSQ15046 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KARSQ15046 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KARSQ15046 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KARSQ15046 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KARSQ15046 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KARSQ15046 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KARSQ15046 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
KARSQ15046 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KARSQ15046 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KARSQ15046 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KARSQ15046 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KARSQ15046 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KARSQ15046 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KARSQ15046 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KARSQ15046 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KARSQ15046 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KARSQ15046 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KARSQ15046 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
KARSQ15046 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KARSQ15046 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KARSQ15046 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KARSQ15046 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KARSQ15046 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KARSQ15046 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KARSQ15046 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KARSQ15046 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KARSQ15046 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KARSQ15046 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KARSQ15046 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KARSQ15046 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KARSQ15046 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KARSQ15046 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KARSQ15046 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KARSQ15046 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KARSQ15046 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KARSQ15046 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KARSQ15046 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KARSQ15046 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KARSQ15046 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KARSQ15046 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KARSQ15046 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KARSQ15046 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KARSQ15046 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KARSQ15046 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KARSQ15046 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KARSQ15046 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KARSQ15046 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KARSQ15046 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KARSQ15046 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KARSQ15046 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KARSQ15046 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KARSQ15046 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KARSQ15046 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KARSQ15046 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KARSQ15046 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KARSQ15046 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KARSQ15046 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KARSQ15046 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KARSQ15046 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KARSQ15046 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KARSQ15046 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KARSQ15046 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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