Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CHD4Q14839 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHD4Q14839 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHD4Q14839 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
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