Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CIRBPQ14011 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CIRBPQ14011 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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