Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CACNA1SQ13698 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CACNA1SQ13698 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
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