Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TCIRG1Q13488 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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