Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ERCC8Q13216 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ERCC8Q13216 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ERCC8Q13216 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ERCC8Q13216 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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ERCC8Q13216 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ERCC8Q13216 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ERCC8Q13216 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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ERCC8Q13216 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERCC8Q13216 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERCC8Q13216 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms