Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	FAS1	YKL182W	6156 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	DPP1	YDR284C	870 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	GPN3	YLR243W	819 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	UBC12	YLR306W	567 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	HHF2	YNL030W	312 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YOR062C	YOR062C	807 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	TUM1	YOR251C	915 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	APA1	YCL050C	966 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	SMC3	YJL074C	3693 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	HFM1	YGL251C	3564 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	IRC3	YDR332W	2070 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	APC5	YOR249C	2058 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	AI4	Q0065	1671 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	SQS1	YNL224C	2304 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YDR431W	YDR431W	312 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	BRR6	YGL247W	594 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YAL031W-A	YAL031W-A	309 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YKL156C-A	YKL156C-A	117 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YLR169W	YLR169W	354 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	NNT1	YLR285W	786 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YLR400W	YLR400W	474 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	DIA1	YMR316W	1011 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	AAR2	YBL074C	1068 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YNL226W	YNL226W	411 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	GIS2	YNL255C	462 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	ATG3	YNR007C	933 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	MSN1	YOL116W	1149 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YPL168W	YPL168W	1293 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	MTR4	YJL050W	3222 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	HEH2	YDR458C	1992 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	ARP4	YJL081C	1470 nt		3.52	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	MYO5	YMR109W	3660 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	ART10	YLR392C	1557 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YMR018W	YMR018W	1545 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	SLS1	YLR139C	1932 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	snR68	snR68	136 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YDR491C	YDR491C	492 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	THP2	YHR167W	786 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	RPA12	YJR063W	378 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YAL064W	YAL064W	285 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YLR365W	YLR365W	333 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	TRI1	YMR233W	681 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YBL062W	YBL062W	381 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	MRPL17	YNL252C	846 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	RPS7A	YOR096W	573 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	APD1	YBR151W	951 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YBR201C-A	YBR201C-A	204 nt		3.51	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	PSP1	YDR505C	2526 nt		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YDL242W	YDL242W	354 nt		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	RPL24B	YGR148C	468 nt		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	POL32	YJR043C	1053 nt		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	NNF1	YJR112W	606 nt		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	RAD33	YML011C	534 nt		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	MIC27	YNL100W	705 nt		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	SMC2	YFR031C	3513 nt		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YAK1	YJL141C	2424 nt		3.5	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	THO1	YER063W	657 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	ECO1	YFR027W	846 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YGR073C	YGR073C	372 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YHR182C-A	YHR182C-A	474 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	SEC28	YIL076W	891 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YKL131W	YKL131W	522 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YLR347W-A	YLR347W-A	141 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YLR366W	YLR366W	306 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	TVP18	YMR071C	504 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	DLT1	YMR126C	1029 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	RSM19	YNR037C	276 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YBL108W	YBL108W	306 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	MSH2	YOL090W	2895 nt		3.49	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	NMD2	YHR077C	3270 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	BEM4	YPL161C	1902 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	APC11	YDL008W	498 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	AIM11	YER093C-A	414 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	PEX14	YGL153W	1026 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YHL005C	YHL005C	393 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YHR214C-D	YHR214C-D	294 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	SDP1	YIL113W	630 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	VMA5	YKL080W	1179 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YKR011C	YKR011C	1062 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	RPS21A	YKR057W	264 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	SMD3	YLR147C	306 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YAR069C	YAR069C	294 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YMR158C-A	YMR158C-A	138 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YOL114C	YOL114C	609 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	CMD1	YBR109C	444 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	VPS64	YDR200C	1815 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	CHA4	YLR098C	1947 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	TCB2	YNL087W	3537 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	NMA111	YNL123W	2994 nt		3.48	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	VPS3	YDR495C	3036 nt		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	SSE2	YBR169C	2082 nt		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YIL169C	YIL169C	2988 nt		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	PEX6	YNL329C	3093 nt		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	COB	Q0105	1158 nt		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	GEP7	YGL057C	864 nt		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	UPF3	YGR072W	1164 nt		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	AIM25	YJR100C	984 nt		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	YKT6	YKL196C	603 nt		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	MCA1	YOR197W	1299 nt		3.47	□□□□□ -1.85
SYF1	Q04048	21S_rRNA	21S_rRNA	3296 nt		3.47	□□□□□ -1.85

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