Protein–RNA interactions for Protein: P63173

RPL38, 60S ribosomal protein L38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL38P63173 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPL38P63173 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPL38P63173 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPL38P63173 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPL38P63173 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPL38P63173 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL38P63173 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL38P63173 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL38P63173 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL38P63173 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL38P63173 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL38P63173 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL38P63173 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL38P63173 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL38P63173 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL38P63173 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL38P63173 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL38P63173 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL38P63173 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL38P63173 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL38P63173 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL38P63173 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPL38P63173 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL38P63173 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL38P63173 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL38P63173 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL38P63173 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL38P63173 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL38P63173 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL38P63173 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL38P63173 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL38P63173 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL38P63173 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL38P63173 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL38P63173 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL38P63173 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL38P63173 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPL38P63173 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL38P63173 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL38P63173 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL38P63173 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL38P63173 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL38P63173 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL38P63173 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL38P63173 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL38P63173 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL38P63173 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL38P63173 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL38P63173 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL38P63173 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPL38P63173 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPL38P63173 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL38P63173 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL38P63173 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL38P63173 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL38P63173 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL38P63173 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL38P63173 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPL38P63173 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms