Protein–RNA interactions for Protein: P62424

RPL7A, 60S ribosomal protein L7a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL7AP62424 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL7AP62424 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL7AP62424 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL7AP62424 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL7AP62424 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms