Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-16P61578 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms