Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSX2P58304 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSX2P58304 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSX2P58304 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSX2P58304 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSX2P58304 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSX2P58304 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSX2P58304 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSX2P58304 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSX2P58304 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSX2P58304 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VSX2P58304 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VSX2P58304 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSX2P58304 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSX2P58304 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSX2P58304 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSX2P58304 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSX2P58304 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSX2P58304 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSX2P58304 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSX2P58304 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSX2P58304 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSX2P58304 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSX2P58304 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSX2P58304 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSX2P58304 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSX2P58304 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VSX2P58304 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSX2P58304 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSX2P58304 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSX2P58304 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSX2P58304 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSX2P58304 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSX2P58304 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSX2P58304 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSX2P58304 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSX2P58304 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSX2P58304 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
VSX2P58304 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSX2P58304 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSX2P58304 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSX2P58304 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSX2P58304 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VSX2P58304 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
VSX2P58304 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
VSX2P58304 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VSX2P58304 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSX2P58304 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSX2P58304 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSX2P58304 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSX2P58304 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSX2P58304 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSX2P58304 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VSX2P58304 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSX2P58304 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSX2P58304 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VSX2P58304 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VSX2P58304 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VSX2P58304 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VSX2P58304 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms